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Science 杂志,第337卷,总第6099期2012年9月7日:1159-1161

发布者:鑫达医学翻译 发布时间:2012-09-13 8:50:52 阅读:

DOI: 10.1126/science.337.6099.1159
链接:http://www.sciencemag.org/content/337/6099/1159.full
题目:DNA元件百科全书(the Encyclopedia of DNA Elements,ENCODE)书写冗余DNA的赞歌
    上个星期,《自然》杂志和《科学》杂志发表的30篇研究论文(其中前者刊发6篇,其余由后者刊发)彻底敲响了人类基因组中大部分碱基无用这一观点的丧钟。文中Elizabeth Pennisi详细梳理了始于2003年美国国立人类基因组研究所 (National Human Genome Research Institute) 发起的ENCODE项目的整个发展历程。ENCODE项目研究表明,人类基因组只有3%用于蛋白表达,包括20,687蛋白表达基因以及50多个不确定的基因,另有11,224 个假基因,假基因只在某些细胞系或者某些个体内表达。其余90%以上本来被认为是冗余的垃圾DNA序列也都会转录成RNA,ENCODE定义了8800个小RNA分子和 9600长度超过200 bp的非编码RNA,其中某些RNA分子在细胞内具有自我定位功能,转录后到达特定的区域发挥功能。ENCODE研究改变了人们对遗传本质的认识,遗传的基本单位是这些DNA转录本----RNA,而不是一直以来认为的基因。ENCODE还筛选检测了基因组相关的蛋白调控因子及其在基因组序列上作用的位置,而且分析建立了这些调控因子的相互作用网络。另外ENCODE还从一个较宏观的角度,对染色体之间互作的核苷酸区域进行了研究。至今,ENCODE已投入2亿8千8百万美元,包括先期项目的投入,相关研究技术的开发,以及用于鼠、线虫和果蝇的研究,共发表400余篇研究论文,而且这些研究成果正在运用到其他110多个研究项目中。

Science 7 September 2012:  Vol. 337 no. 6099 pp. 1159-1161 DOI: 10.1126/science.337.6099.1159
NEWS & ANALYSIS
GENOMICS
ENCODE Project Writes Eulogy for Junk DNA
Elizabeth Pennisi
This week, 30 research papers, including six in Nature and additional papers published online by Science, sound the death knell for the idea that our DNA is mostly littered with useless bases. A decade-long project, the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), has found that 80% of the human genome serves some purpose, biochemically speaking. Beyond defining proteins, the DNA bases highlighted by ENCODE specify landing spots for proteins that influence gene activity, strands of RNA with myriad roles, or simply places where chemical modifications serve to silence stretches of our chromosomes.

ENCODE相关中文专题:
ENCODE:“DNA元素百科全书”生物谷专题
http://www.bioon.com/z/bioonnews_20120907/
ENCODE相关30篇论文摘要 聚焦人基因组功能研究(一)
http://www.bioon.com/biology/news/529350.shtml
ENCODE相关30篇论文摘要 聚焦人基因组功能研究(二)
http://www.bioon.com/biology/news/529439.shtml


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