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黄瓜花叶病毒的核酸序列变异及其进化分析

发布者:鑫达医学翻译 发布时间:2012-10-10 8:50:52 阅读:

    过去的许多研究已经证明CMV是一种高变异率的病毒。在早期,针对CMV的寄主范围、致病性、血清学和核酸序列分析数据表明,CMV可以大致上分为两个亚组。1992年,Palukaitis等根据CP基因同源性CMV分为亚组I和亚组II,不同亚组株系间的CP核酸序列同源性在69%~77%之间,而同一亚组的株系间的核酸序列同源性在88%以上。随着越来越多的不同株系的CMV全序列的测定,Roossinck等在1999年根据CMV CP基因和RNA3 5’NTR核酸序列同源性和进化分析将CMV亚组I进一步分为亚组IA和亚组IB。其中亚组II的核酸序列保守性最高,组内核酸序列同源性达到96%以上;而亚组IB的组内核酸序列同源性最低,只有90%左右。CMV亚组IA和亚组II株系在全世界都有分布,无明显的地域性。而亚组IB株系却主要分布于东亚地区,在东亚以外地区,仅在意大利和美国发现过3株亚组IB株系。Gallitelli等对发现于意大利的亚组IB株系Tfn研究表明,这株CMV很有可能是新近从东亚传入的,而并非源于意大利本土。CMV亚组I株系和亚组I株系之间在致病性、发病季节和发生率等方面都有明显的差异。Wahyuni等经过比较不同亚组的CMV后发现,CMV亚组I株系从病毒积累速度和致病性来看,都要高于亚组II株系。另外,很多对CMV天然种群的研究表明,CMV亚组I株系的发生率远高于亚组II株系。Fraile等对采样于西班牙的不同年份和不同地区的CMV研究表明,CMV亚组II株系只发生于秋季,而CMV亚组I株系却不局限于发生在秋季。这表明CMV亚组I株系对较高温度有更高的耐受性。Lin等利用SSCP技术对美国加利福尼亚洲的野生CMV群体研究发现,79株CMV亚组IA的CP 基因表现出了较大的变异性,但是这种变异与其采集年份、地域和寄主种类都没有直接联系,形成了meta-种群结构。这种随机变异的CMV种群结构与寄主作物和蚜虫的季节性死亡是直接相关的。


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