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黄瓜花叶病毒的分组及其变异

发布者:鑫达医学翻译 发布时间:2012-10-27 8:50:52 阅读:


RNA病毒由于其RdRp复制的错误倾向、快速的复制周期和庞大的群体数量导致RNA病毒的快速变异。突变、重组和假重组是RNA病毒变异的主要源动力。病毒RNA复制和转录(包括逆转录)过程的出错率为10-3~10-5,因此RNA病毒具有高度变异性。CMV作为典型的三分体正链RNA病毒,侵染的寄主繁多,加上环境的不断改变,因此已有研究表明CMV是一种高突变频率的病毒。CMV不同株系在寄主适应性和引起寄主病理症状方面有很大的不同:它们有的只能侵染特异种类的寄主植物;有的能侵染其它寄主植物但是却不能系统侵染;有的只引起寄主的微小病理反应,有的却能导致寄主的系统性坏死。造成这些差异的原因是由于不同的寄主和环境对不同的CMV突变体进行自然选择的结果。这种差异常常被用来进行CMV和其他病毒以及CMV株系之间的鉴定。国内学者根据CMV侵染的寄主范围,将来源于蔬菜作物上的CMV分离物划分为十字花科株系群、普通株系群以及茄科株系群等6个株系群。

目前国内外较为普遍接受的分类是Palukaitis等在1992年根据CP核苷酸序列同源性将CMV分为亚组I和亚组II,两个亚组间的CP核苷酸序列同源性在69%~77%之间,而同一亚组内株系间的核苷酸序列同源性在88%以上。通过比较不同亚组的CMV后发现,CMV亚组I株系从病毒积累速度和致病性来看,都要高于亚组II株系。在Subgroup I中,Roossinck等在1999年根据CMV RNA3的CP基因和5′ NTR核苷酸序列的系统发生关系将其进一步分为亚组IA和亚组IB, RNA3的ORF的序列在单源簇(monophyletic cluster)划分为Subgroup IA,而无源簇(nonmonophyletic cluster)则为Subgroup I B,这是由RNA3的非编码区存在的重组、缺失和插入所引起。亚组II株系之间的核酸序列保守性最高,有96%以上;而亚组IB株系之间的核酸序列同源性最低,只有90%左右。CMV亚组IA和亚组II株系在世界各地均有分布,无明显的地域性,而亚组IB株系主要分布于东亚地区。在自然条件下,除CMV株系自身内部的突变之外,不难发现不同株系之间发生重组或重排的现象。例如Goto等人发现了CM95的2b蛋白第95位氨基酸自发突变体CM95R。还有Lin等通过调查加州的CMV分离物,他们发现亚组IA和IB株系之间发生重组,并在亚组IA株系内部发生重排。Chen等在上海感病的番茄植株中分离获得一株由亚组I RNA2和亚组II RNA1和RNA3组成的亚组间重组病毒TSh-CMV。而且在某些CMV株系,其基因组RNA1、2和RNA3分别属于不同的亚组,可能是由于 CMV的3个基因组片段具有不同的进化趋势造成。所以说,在自然条件下不难发现CMV的突变株。
 


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